MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosaeta concilii GP6 chromosome

Total Repeats: 9995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015416	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015416	AAG	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015416	CAT	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015416	CTT	2	6	3064	3069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015416	TGG	2	6	3104	3109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015416	TCT	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015416	TTTG	2	8	3238	3245	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015416	ATG	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015416	CTG	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015416	TCA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015416	A	6	6	3450	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015416	CCAGA	2	10	3457	3466	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015416	CAT	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015416	TGA	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015416	CAA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015416	CTC	2	6	3645	3650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015416	GA	3	6	3697	3702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015416	GA	3	6	3719	3724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015416	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015416	AACG	2	8	3832	3839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015416	T	6	6	3855	3860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015416	CG	3	6	3878	3883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015416	GTT	2	6	3919	3924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015416	GGCTC	2	10	3946	3955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015416	CTT	2	6	4011	4016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015416	CAT	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015416	TCT	2	6	4045	4050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015416	TCC	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015416	GCC	2	6	4189	4194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015416	CTA	2	6	4202	4207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015416	TCC	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015416	GCG	2	6	9182	9187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015416	GAT	2	6	9193	9198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015416	T	7	7	9303	9309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015416	ATC	2	6	9320	9325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015416	AAC	2	6	9328	9333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015416	AGA	2	6	9371	9376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015416	A	6	6	9403	9408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015416	TCC	2	6	11519	11524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015416	AC	3	6	11548	11553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015416	CTT	2	6	11592	11597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015416	TAT	2	6	11602	11607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015416	CAC	2	6	11611	11616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015416	A	6	6	11706	11711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015416	T	6	6	11712	11717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015416	TTA	2	6	11736	11741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015416	ATA	2	6	11745	11750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015416	CTG	2	6	11776	11781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015416	TGA	2	6	11844	11849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015416	TAT	2	6	12249	12254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015416	ATT	2	6	13224	13229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015416	AATT	2	8	15991	15998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015416	CTC	2	6	16025	16030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015416	GCT	2	6	16057	16062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015416	CAT	2	6	16081	16086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015416	CGCC	2	8	16096	16103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_015416	TCCTC	2	10	16128	16137	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_015416	CAC	2	6	16176	16181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_015416	GAA	2	6	16189	16194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015416	CCTC	2	8	16292	16299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_015416	CCG	2	6	16320	16325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015416	CCT	2	6	16366	16371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015416	GGC	2	6	16375	16380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015416	ACC	2	6	16433	16438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015416	AGC	2	6	16449	16454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015416	CCAGC	2	10	16522	16531	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_015416	AAGG	2	8	16588	16595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015416	CCT	2	6	16611	16616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015416	CGT	2	6	16812	16817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015416	AGGT	2	8	16877	16884	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015416	CTG	2	6	16948	16953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015416	TGT	2	6	16960	16965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015416	CT	3	6	17026	17031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015416	GGT	2	6	17050	17055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015416	GCC	2	6	17102	17107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_015416	GAA	2	6	17128	17133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015416	GAT	2	6	17164	17169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015416	TC	3	6	17196	17201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015416	TGA	2	6	17202	17207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015416	TGA	2	6	17221	17226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015416	CTAT	2	8	17367	17374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015416	TGC	2	6	17392	17397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015416	GAT	2	6	17449	17454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015416	GAT	2	6	17456	17461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015416	CAC	2	6	17852	17857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015416	ATA	2	6	17878	17883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015416	TGG	3	9	17895	17903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015416	AGG	2	6	19601	19606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015416	A	8	8	19616	19623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015416	CCATG	2	10	19651	19660	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015416	CCT	2	6	19671	19676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015416	ACC	2	6	19759	19764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015416	ACGC	2	8	20982	20989	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015416	TCCT	2	8	21073	21080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015416	CCA	2	6	21083	21088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015416	ATTTT	2	10	21101	21110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015416	ATA	3	9	21150	21158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015416	GAA	2	6	21366	21371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015416	GAA	2	6	21384	21389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015416	CTCTA	2	10	21429	21438	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015416	TAA	2	6	21440	21445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015416	C	7	7	24141	24147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_015416	ATAA	2	8	25029	25036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015416	AGATTA	2	12	25102	25113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015416	A	6	6	25158	25163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015416	ATC	2	6	25965	25970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015416	AT	3	6	26021	26026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015416	GAT	2	6	26072	26077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015416	T	6	6	26087	26092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015416	CATC	2	8	26119	26126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015416	TCACA	2	10	26137	26146	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015416	T	6	6	27334	27339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015416	TA	3	6	28350	28355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015416	AGG	2	6	28416	28421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015416	TCAC	2	8	29944	29951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015416	GTTT	2	8	31873	31880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015416	TAC	2	6	31975	31980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015416	GA	3	6	31981	31986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015416	ATG	2	6	32056	32061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015416	T	8	8	32419	32426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015416	T	7	7	34699	34705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015416	TCT	2	6	34786	34791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015416	TTA	2	6	35278	35283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015416	CATG	2	8	35302	35309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015416	GCTG	2	8	35346	35353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015416	TCG	2	6	36857	36862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015416	ATA	2	6	39394	39399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015416	AG	3	6	39455	39460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015416	GAAG	2	8	39504	39511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015416	GGA	2	6	39531	39536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015416	CTGA	2	8	39589	39596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015416	TATCA	2	10	39599	39608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015416	T	7	7	39609	39615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015416	ATT	2	6	39616	39621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015416	T	6	6	39648	39653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015416	GCT	2	6	39674	39679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015416	ATT	2	6	39690	39695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015416	CAG	2	6	39743	39748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015416	A	6	6	39764	39769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015416	GAG	2	6	39773	39778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015416	ATA	2	6	40239	40244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015416	GCA	2	6	40313	40318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015416	GGCT	2	8	40361	40368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015416	CGAG	2	8	40390	40397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015416	ATT	2	6	40448	40453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015416	T	7	7	40452	40458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015416	A	7	7	40471	40477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015416	TCA	2	6	43085	43090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015416	ATG	2	6	43170	43175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015416	TCT	2	6	44177	44182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_015416	TAA	2	6	44196	44201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015416	GAA	2	6	46305	46310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_015416	AATTG	2	10	46430	46439	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015416	TGA	2	6	46466	46471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015416	ATATA	2	10	47071	47080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015416	TAAA	2	8	47084	47091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015416	AT	3	6	47095	47100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015416	TCA	2	6	47472	47477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_015416	ATT	2	6	47934	47939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015416	ATT	2	6	48003	48008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015416	TCAT	2	8	48741	48748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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286	NC_015416	CTTTT	2	10	97276	97285	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_015416	T	7	7	97282	97288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015416	TTC	2	6	97296	97301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_015416	CTT	2	6	97390	97395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_015416	AAG	2	6	98127	98132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015416	CGAT	2	8	98476	98483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
293	NC_015416	ATCC	2	8	98543	98550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_015416	CAG	2	6	99087	99092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_015416	TC	3	6	107490	107495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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299	NC_015416	A	7	7	107549	107555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015416	A	7	7	107568	107574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015416	A	7	7	107577	107583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_015416	ATA	2	6	108758	108763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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305	NC_015416	ATT	2	6	110818	110823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_015416	T	7	7	115857	115863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_015416	ATA	2	6	115877	115882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_015416	T	7	7	116457	116463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_015416	CATAT	2	10	140806	140815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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430	NC_015416	CAG	2	6	140889	140894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_015416	ATG	2	6	141045	141050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_015416	ATT	2	6	141086	141091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_015416	AAC	2	6	141171	141176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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445	NC_015416	A	8	8	143001	143008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_015416	CAG	2	6	146109	146114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_015416	A	6	6	148702	148707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_015416	TGA	2	6	150958	150963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_015416	ATC	2	6	152278	152283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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494	NC_015416	GC	3	6	159898	159903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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